Pada tahun yang sama di 2005 juga, Gus Yaqut maju mencalonkan diri menjadi Wakil Bupati pada Pilkada 2005 dan terpilih menjadi Wakil Bupati Rembang (2005-2010) dengan pasangan Bupatinya Pada tahun 2012 Gus Yaqut diberi tanggung jawab yang lebih besar untuk menduduki jabatan Wakil Ketua DPW PKB Jawa Tengah (2012-2017).
Gus Yaqut semakin aktif dalam kancah organisasi masyarakat dan politik dengan melebarkan sayap organisasinya hingga pada tahun 2015 diberi tanggung jawab untuk memimpin organisasi sayap kepemudaan terbesar dan tertua di Indonesia yaitu Gerakan Pemuda Ansor sebagai Ketua Umum PP GP Ansor masa jabatan periode tahun 2015-2020.
Gus Yaqut dilantik menjadi Anggota DPR-RI periode 2014-2019 sebagai Pergantian Antar Waktu (PAW) menggantikan Hanif Dhakiri yang dilantik menjadi Menteri Tenaga Kerja di Kabinet Kerja Presiden Jokowi[17] dan saat ini menempati jabatan di Komisi VI - Perdagangan, Perindustrian, Investasi, Koperasi, UKM & BUMN, Standardisasi Nasional.
Karier Gus Yaqut
Baca Juga:Yaqut Cholil Quomas Jadi Menteri Agama Gantikan Fachrul Razi
- Ketua Umum PC PMII UI-Depok 1996-1999
- Ketua DPC PKB Kabupaten Rembang 2001-2014
- Ketua Pimpinan Pusat GP Ansor[18] 2011-2016
- Wakil Ketua DPW PKB 2012-2017
- Ketua Umum Pimpinan Pusat GP Ansor 2015-2020
- Anggota DPRD Kabupaten Rembang 2005
- Wakil Bupati Rembang 2005-2010
- Ketua Yayasan KH. Bisri Mustofa Rembang 2012-Sekarang
- Anggota DPR - RI: 2014 - 2019
- Anggota DPR - RI: 2019 - 2024
